《起源》包含多个相对独立，却有紧密联系的故事。
《起源》第一部【星际争霸】篇主要讲述三个异族朋友和他们的追随者，追寻“起源”的故事。
“起源”是这个层次宇宙最古老的民族Original的散落星际间的神秘遗物，据说包含所有秘密的最终答案。
作为“起源”的创造者，Original注定是宇宙中最为神秘和古老的文明。
因为年代的久远和与之文明等级的差异，现代文明中对于Original所知甚少。
目前所有关于Original的信息全部整理于它们残留于Protoss和Zerg模糊不清的潜意识层。我们只知道Original爱好创造生命和文明，并将此视为己任。但是为什么要创造完美的生命和文明却不得而知。
或许所有的答案都藏于传说中Original的遗物“起源”。
Protoss是Original创造的第一个种族。
与Original一样，我们对Protoss所知甚少。通过那些令人类无比羡慕和倍感惊艳的已知技术，我们猜测它们具备高度发达的科技，并且拥有神奇的精神力量。由于采用单性繁殖的方式延续种族，Protoss的每一个生命个体都极其宝贵。
高度发达的科技配合神奇的精神力量，Protoss的作战方式和军事单位处处都体现出神奇、简单、刚猛的风格。所以，在茫茫宇宙中Protoss是唯一被人类崇拜和痛恨的种族。鉴于崇拜和痛恨并存的矛盾心理，人类总是喜欢称Protoss为“神族”。
不过由于某种原因，Original认为Protoss具有不可修复的缺陷。他们最终离开了Protoss，前往宇宙深处进行新的实验。
Original在银河系炎热的中心旅行了数千光年，最后来到了覆满灰烬，所有事物变化极快的异烙斯星（Zerus）。Original将他们庞大的船只停靠在异烙斯星的上空，再一次的，向造物主的命运挑战继续他们伟大的进化实验。
被人类痛恨厌恶称之为“虫族”的异形种族Zerg诞生了。
靠着Original的基因操控所提供的竞争力，Zerg在自己星球上的火焰暴风中存活了下来，开始繁衍进化。它们在这种恶劣的环境中发展出了一种惊人的能力。那就是钻进当地生物的体内，藉着吸取这些宿主的脊髓液，完美利用并改造这些基因进而完成更高级的进化。任何异形遭遇到的其他种族，一旦被判别为不值得吞并，立刻被无情的彻底消灭，以保障自我基因链的纯粹。
实际上整个种族共享一个意识统一、集合成一个称作“主宰”集体意识，它没有太多的感情系统。主宰代表了异形们最基本的生存意志和欲望意识。随着时间的流逝，主宰终于慢慢的发展出了自我意识和高超的智慧。
Original欣喜异常，对这个作品的成功充满了骄傲。殊不知自己正面临着灭亡。
Zerg的主宰慢慢感觉并意识到Original的存在。它开始观察漂浮在异烙斯上空的巨大星船。
在主宰意识到时机成熟之后，一直持续的保持对主宰的监控Original，突然惊恐的发现主宰冷漠的切断了双方之间的心灵连结，并且有效的让自己无法侦测。
主宰将异形们同化的欲望激发到最高点，趁着Original慌乱的时候，对自己的创造者派出了新一代的太空异形。
这个令古老的种族最骄傲的作品并没有让他们自己失望。尽管具备可以逆天的能力，但异形们一波接一波，毫无退意的进攻仍然在短短的几个小时之内，就突破了他们的强大的防御，彻底摧毁了整个Original的舰队。
Original最终毁灭在了自己作品的手里。
当异形种族吞噬了自己造物主体内的基因漩涡之后，主宰吸收了他们造物主的一切知识和力量，成长到难以想像的境界。
主宰意识到被造物主视为最成功作品的自己并不完美。但是籍着Original的所有记忆，它发现了宇宙另一端的Protoss。它准确的分析出Protoss被Original唾弃的不可修复的缺陷恰恰能够帮自己完成更完美，更高级的进化。而自己的缺点却能对Protoss的缺陷进行修补。
主宰意识到，神民和异形之间的毁灭性冲突是无可避免的。它最终进行基因突变，踏上寻找征服Protoss的道路。
在异族的征服之路上，主宰遇到了人类。
这个一开始被主宰判定为不值得吞并的低劣种族却很快的引起了主宰的重视。对异族来讲这绝对是血的教训。数以万计的异形毁灭在人类的钢铁洪流之中。
异族不得不决定在未征服Protoss之前，认真的对待这个看似弱小却韧性极强的种族。
实际上，茫茫宇宙中三个形态各异的种族并不知道自己最真实的使命和三者彼此之间的真正关系。但是这丝毫不会影响到他们不可避免的文明冲突。因为他们的赖以生存的能源体系都建立在同一种物质“矽矿”身上。矽矿将这三个星际中最高级的文明残酷拉回了原点。在没有能源就注定会灭亡的不变定律下，他们只能穷尽所能的去厮杀。
我们的故事，就从这里开始！